М.: УРСС; Ленанд, 2014. — 412 с. — ISBN 978-5-9710-0842-2, 978-5-453-00057-9.
Молекулы белков лежат в основе почти всех биологических процессов. Ученым всегда были любопытны как белки, участвующие в метаболических путях, так и молекулярные основы их функционирования. Однако в эру системной биологии еще больше внимание уделяется полному пониманию работы всей совокупности белков организма, его протеома. Все более важно, что мы не только понимаем все стороны данной функции, или функций, какого-либо белка, но и то, что наше знание распространяется на все компоненты изучаемой системы или организма и так далеко, насколько это возможно. Без всестороннего анализа информации попытки синтеза и расчетов не смогут выйти за рамки приближенной реальности.
Книга Структура и функционирование белков. Применение методов биоинформатики представляет собой уникальный обзор современного состояния вопросов моделирования структуры белков и предсказания их функции. Книга написана ведущими специалистами в своей области, прекрасно иллюстрирована и содержит ссылки на доступные серверы и другие ресурсы, которые читатель, возможно, захочет использовать в своей научной работе. В конце каждой главы описываются перспективы развития и наиболее актуальные проблемы соответствующих областей науки.
На сегодняшний день научное сообщество довольно близко подошло к объяснению явлений, природа которых до недавних пор была не ясна, - таких как обмен доменов, круговая перестановка, образование фибрилл, белки с присущей неупорядоченностью и многими другими. В 2008 году мы сталкиваемся с метаморфными белками, исследование которых может значительно поспособствовать нашему пониманию пространства типов укладки белков. И, несмотря на то, что структуры белков непрерывно готовят нам новые трудности, совершенно ясно, что биоинформатика структуры и функции белков на протяжении многих лет будет оставаться одной из самых востребованных и волнующих областей исследований.
Книга рассчитана на студентов, аспирантов и специалистов, интересующихся вопросами молекулярного моделирования и биоинформатики.
СодержаниеПредсказание структуры белков ab initio
Распознавание фолда
Сравнительное моделирование структур белков
Предсказание структуры мембранных белков
Методы биоинформатики для изучения структуры и функции неупорядоченных белков
Функциональное разнообразие в элементах упаковки и надсемействах
Предсказание функции белка по свойствам его поверхности
Пространственные мотивы
Динамика белков: от структуры к функционированию
Интегральные серверы для предсказания функции по структуре
Примеры: предсказание функции структур, полученных в проектах по структурной геномике
Предсказание функции белков на основе их теоретических моделей