Biochemistry Review Dr Hoda Alkholy

Cover
......Page 1
Contents
......Page 3
1 Basic Concept of Metabolism
......Page 5
2 Electron Transport Chain
......Page 7
3
Hormones......Page 11
Insulin......Page 14
Glucagon......Page 17
Catecholamines......Page 18
steroid, thyroid hormones, active vitamin D (Calcitriol) and vitamin A or retinoic acid
......Page 21
Monosaccharides......Page 22
Disaccharides......Page 23
Homopolysaccharides......Page 24
Hyaluronic acid......Page 25
Heparin......Page 26
Carbohydrate (CHO) Metabolism......Page 27
Glycolysis......Page 30
Lactate......Page 38
Alcohol metabolism......Page 41
Citric acid cycle
......Page 43
Hexose Monophosphate Pathway (HMP) or (Pentose phosphate pathway)
......Page 46
Uronic Acid Pathway
......Page 50
Glycogenesis......Page 51
Glycogenolysis......Page 53
Gluconeogenesis......Page 56
Galactose Metabolism......Page 59
Fructose Metabolism......Page 60
Blood glucose
......Page 63
Hypoglycemia......Page 65
Diabetes Mellitus (DM)......Page 66
Type I diabetes mellitus......Page 67
Type 2 diabetes mellitus
......Page 69
Complications of DM
......Page 70
Glycosuria......Page 75
5
Protein Chemistry And Metabolism......Page 77
Amino acids......Page 78
Peptides......Page 80
Protein structure (folding)......Page 81
Protein Misfolding......Page 82
Collagen......Page 85
Amino acid pool......Page 88
Protein Turnover......Page 91
General metabolic pathways of amino acids
......Page 92
Metabolism of Ammonia......Page 96
Urea cycle......Page 100
Glutamine Metabolism......Page 102
Glycine......Page 103
Creatine Metabolism......Page 105
Glutathione......Page 107
Phenylalanine......Page 108
Catecholamine......Page 110
Melanin pigment......Page 112
Thyroid hormones......Page 113
Glutamic acid......Page 118
Tryptophan......Page 119
Serotonin metabolism......Page 120
Melatonin metabolism......Page 121
Arginine amino acid......Page 122
Serine amino acid metabolism......Page 123
Methionine amino acid......Page 124
Histidine amino acid......Page 126
Branched. chain amino acids......Page 127
6
Neurotransmitters......Page 128
Hemoglobin......Page 130
Myoglobin......Page 132
Biosynthesis of Hemoglobin......Page 133
Catabolism of Hemoglobin......Page 138
Hyperbilirubinemia and jaundice......Page 142
Sickle cell anemia (hemoglobin S disease)
......Page 146
Thalassemia......Page 148
8
Immunoglobulin......Page 150
Immunoglobulin A (IgA)......Page 151
Immunoglobulin D (lgD)......Page 152
Alcohols......Page 153
Steroid alcohol (cholesterol)
......Page 154
Chemical Classification......Page 155
Unsaturated Fatty Acids (PUFA)......Page 156
Simple lipids......Page 157
Glycerophospholipids......Page 158
Glycolipids......Page 159
Steroids......Page 160
Lipid Metabolism......Page 161
Disorders of lipid digestion and absorption......Page 164
Lipogenesis
......Page 165
Lipolysis......Page 166
Fatty acid synthesis......Page 168
Oxidation of Fatty Acids
......Page 169
Metabolism of Ketone Bodies......Page 174
Hormonal regulation......Page 177
Ketonuria
......Page 178
Metabolism of Compound Lipids......Page 179
Eicosanoids......Page 180
Prostaglandins
......Page 181
Leukotrienes
......Page 184
Metabolism of Cholesterol......Page 185
Bile acids & Salts
......Page 188
Steroid Hormones
......Page 191
Plasma Cholesterol......Page 192
Plasma Lipoproteins......Page 193
Metabolism of Chylomicrons......Page 195
Metabolism of LDL......Page 198
Metabolism of HDL......Page 200
Fatty liver
......Page 203
Atherosclerosis and ischemic heart diseases......Page 205
Obesity......Page 209
Fed or the absorptive state
......Page 212
Liver in absorptive state
......Page 214
Resting skeletal muscles in absorptive state......Page 215
The liver during fasting state......Page 216
Adipose tissue in fasting......Page 217
Brain in fasting
......Page 218
11
Vitamins......Page 219
Vitamin A......Page 221
Vitamin D......Page 224
Vitamin E......Page 227
Vitamin K......Page 228
Thiamine (vitamin B1)
......Page 230
Niacin (vitamin B3) (Nicotinic acid)
......Page 232
Pyridoxine (Vitamin B6)
......Page 233
Folic Acid (Folate)......Page 234
Vitamin B12 (Cobalamin)
......Page 236
Ascorbic Acid (Vitamin C)
......Page 239
Free radicals......Page 241
Antioxidants......Page 244
13
Enzymes......Page 247
Factors affecting the enzyme activity......Page 249
Inhibition of enzyme activity......Page 251
Regulation of the enzyme activity......Page 253
Plasma enzymes in clinical diagnosis......Page 254
III) Lactate dehydrogenase (LDH)
......Page 255
VI) Lipase......Page 256
Biochemical Markers of Acute Myocardial Infarction......Page 257
Nitrogenous bases......Page 259
Pentose sugar......Page 260
Nucleic acid structure......Page 262
Chemistry of RNA (Ribonucleic acid)......Page 264
I-Messenger RNA (m RNA)
......Page 265
Ill-Transfer RNA (tRNA)......Page 267
DNA......Page 268
DNA synthesis (Replication)......Page 270
DNA damage and repair......Page 273
TRANSCRIPTION......Page 275
POST -transcription modifications of RNA......Page 277
GENETIC CODE......Page 280
Point mutation......Page 282
Frame-shift mutations......Page 283
Protein Synthesis (Translation)......Page 284
Post-translational modifications......Page 286
Antibiotics and Protein Synthesis......Page 288
Cell cycle......Page 289
GENE THERAPY......Page 291
Apoptosis (Cell Suicide)......Page 292
Polymerase chain reaction......Page 293
Gout
......Page 295
Adenosine deaminase deficiency
......Page 296
Lesch-Nyhan syndrome......Page 297
Calcium......Page 298
Phosphorus......Page 303
Sodium......Page 304
Sulfur......Page 305
Iron (Fe)......Page 306
Copper......Page 309
Iodine......Page 310
Selenium......Page 311
Bone Matrix......Page 312
Blood......Page 314
Urine......Page 317
Semen (Seminal fluid)
......Page 320
Milk......Page 321
Saliva......Page 324
20
Biochemistry Of Cancer......Page 325
Tumor markers......Page 326
pH scale......Page 329
Buffers......Page 330
Renal regulation of pH......Page 332