Contenido
Primera Parte: El Curso de la Vida
Capítulo 1 Origen y Crecimiento del Pensamiento Evolutivo, 37
Precursores del pensamiento evolutivo, 40; Las ideas de Charles Darwin (1809-1882),
58; Argumentos que apoyan la evolución, 63; Externalismo versus internalismo, 68
Capítulo 2 Historia Planetaria y Vida Primigenia, 71
Historia de la vida en la Tierra y el registro fósil, 74; Fósiles y la explosión del
Cámbrico, 74; Burgess Shale, 78; Colonización del ambiente terrestre, 85; El contexto
histórico de la evolución de los cordados, 87; Extinciones masivas, 93
Capítulo 3 Sistemas Complejos y Orígenes del Orden, 97
El modelo de la complejidad, 100; Teoría general de sistemas, 102; Estructuras
disipativas, 103; Origen del orden y autoorganización de la materia, 105; Teoría del
Caos, 107; Geometría fractal de la naturaleza, 108; Gaia: el Planeta Viviente, 109; El
modelo de las margaritas, 110
Capítulo 4 Síntesis Moderna o Neodarwinismo, 113
Adaptacionismo, 118; El gradualismo filético, 120; Equilibrios intermitentes, 121;
Selección de especies, 123; La darwinización de Mendel, 126; La neodarwinización
de la ecología, 128
Capítulo 5 Equilibrio Poblacional, 131
La visión poblacional de la evolución, 135; El axioma de Hardy-Weinberg como
principio antievolutivo, 138; Factores de cambio de las frecuencias génicas, 140;
Mutación, 140; Mutaciones adaptativas, 141; Selección natural, 143; Cálculo de la
adecuación biológica (w) y del coeficiente de selección (s), 143; Selección total contra
un alelo dominante, 145; Selección parcial contra el alelo recesivo, 146; Selección
natural,, 146; modelos genético-cuantitativos, 146; y la evolución de la plasticidad
fenotípica, 146; Selección direccional, 147; Selección estabilizante o normalizante,
147; Selección diversificante o disruptiva y mantención de los polimorfismos
balanceados, 148; Carga genética y costo de la selección, 150; Endogamia, 151;
Coeficiente de endogamia (F), 152; Cambios aleatorios en las frecuencias alélicas:
deriva génica (σ), 154; Cuellos de botella demográficos y genéticos producidos por
erupción volcánica, 156; Poblaciones y biología de la conservación, 157; Tamaño
poblacional efectivo ( Ne ), 158; Influencia de las fluctuaciones poblacionales
sobre el Ne, 159; Efecto fundador, 161; Controversias poblacionales, 162; Genética
cuantitativa, 168; Selección natural y genética cuantitativa , 170; El origen de la
endotermia, 171
Capítulo 6 Especies y Especiación: Realidad, Proceso y Resultado, 175
Las especies, 177; El concepto biológico de especie, 181; Concepto fenético de especie,
183; Las especies bacterianas, 184; Especiación, 186; Críticas a la visión neodarwiniana
de especiación, 187; Especiación mediante hibridización, 187; Especiación mediante
duplicación genómica total: alopoliploidía, 190; Especiación alopátrica, 191; Especies
en anillo, 196; Experimentos de laboratorio en especiación, 197; Especies y radiación
adaptativa, 198; Realidad de las especies, 199; Genómica y especiación, 201; Cómo
procede el origen de las especies, 202; Consideraciones epistemológicas sobre la
especiación, 203
Capítulo 7 Sistemática e Inducción Filogenética, 205
Transformación de los caracteres, 209; Cladogramas y árboles, 211; Árboles
enraizados y no enraizados, 213; Filogenia, sistemática y homología, 215; Escuelas de
clasificación, 216; Observaciones, rasgos y evidencias en el pensamiento filogenético,
218; Inferencia filogenética, 219; Análisis de los caracteres, 220; Métodos algorítmicos
de reconstrucción filogenética, 220; Métodos de optimización, 222; Evaluación y
confiabilidad de los métodos de inferencia filogenética, 223; Duplicación génica
y homología molecular, 223; Pasos hacia una nueva concepción filogenética, 224;
Reticulación, 228
Capítulo 8 Descendencia con Modificación y el Árbol de la Vida, 233
Plantae, 240; Panorama actual de la clasificación animal, 245; El árbol de la vida, 248
Capítulo 9 Biogeografía, Deriva Continental y Migraciones, 253
Origen de los continentes, 258; Deriva continental, 261; Tectónica de placas, 263;
Disgregación del supercontinente Pangea, 264; Escuelas biogeográficas, 267; Regiones
o reinos biogeográficos, 272; Filogeografía y teoría de coalescencia, 274; Teoría de
coalescencia, 275; Biogeografía de islas, 279; El Gran Intercambio Biótico Americano
(GIBA), 280; Orogénesis de los Andes y GIBA, 285; Indicadores biogeográficos:
Nothofagus,287; La Amazonía través del tiempo, 288; Mares interiores, Pebas y la
biota sudamericana, 289; Origen de las gallinas en Sudamérica, 290; Origen de los
roedores en Sudamérica, 291; Origen y evolución de los marsupiales, 291; Glaciaciones,
292; Patagonia, glaciaciones cíclicas y desplazamientos bióticos , 292; Alteraciones
climáticas y bióticas en el extremo austral del Cono Sur , 294; Poblamiento humano
de América, 296; Huellas genéticas humanas, 297; La ruta de migración costera, 298;
El origen híbrido de Homo sapiens,302; Contrastación de hipótesis en biogeografía,
305
Capítulo 10 Cromosomas y Herencia Vertical, 309
Centrómeros, 315; Traslocaciones robertsonianas, 318; Diferencias cromosómicas
y especies crípticas en jerbos del género Taterillus,319; El modelo de especiación
cromosómica, 320; Ingeniería evolutiva y especiación cromosómica, 323; Especiación
por poliploidía, 324; Transformación de los sistemas de determinación del sexo, 328;
Determinación cromosómica del sexo en mamíferos, 330; Determinación del sexo sin
Sry y sin cromosoma Y, 330; Compensación de dosis e inactivación del cromosoma
X en mamíferos euterios, 331; Estimación del número cromosómico ancestral de los
vertebrados, 334
Capítulo 11 Transformaciones Moleculares y Genómicas, 339
Teoría neutral de evolución molecular, 342; El Reloj Molecular, 345; Los genes de
eucariontes, 348; Tasas de sustitución nucleotídica, 350; Elementos no codificantes
y cambios genéticos rápidos y neutros, 354; Duplicación génica y adaptación, 356;
Evolución concertada, 359; Un delirio reduccionista:, 360; el gen como unidad
evolutiva, 360; Secuencias repetidas, LINES y la evolución del genoma, 362;
Evolución genómica y la paradoja del Valor C, 363; Visión panorámica de algunos
genomas completos [Diatomeas, 371; Algas, 372; Plantas, 372; Betarraga, 373;
Protistas, 373; Paramecium tetraurelia, 373;El genoma de las esponjas y la evolución
de la complejidad animal, 375; Ctenóforos, 375; Cefalópodos, 376; Equinodermos,
377; Tunicados, 377]; Genómica comparada de cordados [El genoma de amphioxus
(Branchiostoma floridae),378; Genomas de peces, 379; El genoma de la gallina, 380;
El genoma del ornitorrinco (Ornithorhynchus anatinus),381; El genoma marsupial,
382; El genoma de los euterios: la rata (Rattus rattus),384; El genoma del ratón
(Mus musculus),385; El genoma humano (Homo sapiens)y del chimpancé (Pan
troglodytes),385]; El genoma antes y después de la secuenciación, 389; Dinámica
genómica y macroevolución, 391
Segunda Parte: otro Curso de la Vida
Capítulo 12 Macroevolución, 397
Introducción, 399
Transferencia lateral de genes, flujo génico a través de la biosfera, 404
Transferencia de genes, cromosomas y genomas completos, 408; Origen asexual de
especies poliploides por TGL, 409; Transferencia lateral de genes a través del Árbol
de la Vida, 410; Adquisición de adaptaciones complejas por transferencia génica
lateral, 412
Alopoliploidía: hibridización, de linajes y duplicación genómica total, 415
Hipótesis 2R, 3R y 5R, 416; Poliploidía en bacterias, 419; Poliploidía en animales,
420; El caso del roedor imposible, 420; Hipótesis 2R de poliploidización en los
vertebrados, 423; Hipotesis 5R en vegetales, 427
El paradójico origen de los Phyla, 429
Crustáceos [Cirripedia, 434; Sobre el origen híbrido de los percebes (Thecostraca,
Cirripedia), 436; Rhyzocephala, 436]
A la caza de la realidad: el controvertido origen de las larvas, 438
[Incongruencias larvarias, 440]; Phyla animales con larva trocófora: poliquetos,
equiuroideos, sipunculoideos y moluscos, 442; Origen del lofóforo y de las quimeras,
445; Origen de la larva de los cordados, 447; Experimentos de hibridización entre
ascidias y erizos de mar, 447
Radiación macroevolutiva de los mamíferos euterios, 450
Capítulo 13 Novedades Evolutivas, 455
Introducción, 457
Despliegue evolutivo del mundo bacteriano, 461
El Dominio Archaea , 461; El pangenoma bacteriano, 462; Percepción mayoritaria
(quorum sensing),467
El origen de la multicelularidad, 469
Multicelularidad naciente: las esponjas, 471; Origen de los sistemas neurales: los
ctenóforos, 473; Origen de los cnidocitos de Cnidaria, 474; Origen de los Eucariontes,
475; Origen del núcleo, 479; Acerca del origen de las plantas, 480
Novedades del desarrollo y las raíces de Evo-Devo, 484
Novedades ontogenéticas, 485; Biología molecular del desarrollo , 489; La epigénesis,
492; Regulación génica en cis, 494; La orquestación del desarrollo en Drosophila
melanogaster,497; Los genes Hox en Drosophila melanogaster,501; Los genes Hox en
mamíferos, 503; Origen de la cabeza y del cerebro de los vertebrados, 504; Regulación
génica y relojes circadianos, 505; Reclutamiento génico (coopción), 506; La ontogenia
vegetal, 507; Homologías profundas, 508; Inferencia ontogenética: el ancestro
Urbilaterio, 511; Reorganización genómica, metamorfosis y macroevolución en insectos
holometábolos, 512; El paradigma evolutivo Evo-Devo, 513; Éxtasis y agonía de los genes
Hox, 518; Evolución de los rasgos complejos, 522
Emergencia, sistemas complejos y origen de la vida, 527
Vida primigenia, 530; El origen de la vida, 534
Capítulo 14 Epistemología, Contexto Histórico y Teoría Evolutiva Actual, 543
Adam Smith, el libre mercado, 545; y la economía de la naturaleza, 545
Herbert Spencer (1820-1903) y la sobrevivencia del más apto, 548; La doctrina del shock,
Malthus y la eugenesia, 550; Darwin al desnudo, 554; Darwinismo social. Un ejemplo, 556
La estructura de la síntesis evolutiva y sus limitaciones, 559
Las dificultades del darwinismo, 562 [Ideas lamarckianas, 562; Desdén por la
macroevolución, 562; La pugna estructura-función, 563; Extrapolación, 563; Confusión
entre eliminación por selección natural, 563; y muerte por predación, 563; La vida
como un campo de batalla, 563; El sojuzgamiento de la naturaleza, 564; Quimerismo y
argumentación post hoc,565; Explicación ambiental en referencia a los Rhizocephala
(Crustacea, Cirripedia), 566]; Domesticación de Evo-Devo, 567; Hipótesis ecológicas
sobre la explosión del Cámbrico, 568; Interpretaciones filogenéticas, 569
La visión de recepción de la teoría evolutiva, 570
La teoría sintética de la evolución como sistema axiomático, 574; Principios
axiomáticos, 575; Axiomas darwinianos y neodarwinianos, 576
La vision semántica de la teoría evolutiva, 582
Filosofía popperiana, método hipotético-deductivo y creacionismo, 588
Modelos biológicos, 588; El método hipotético-deductivo, 589; Creacionismo
y evolución, 592; Diseño Inteligente: el nuevo atuendo del creacionismo, 594;
Sociobiología o la biologización de las ciencias sociales, 595
Capítulo 15 Naturaleza y Ética, 597
Simbiosis, holobiontes y singamia, 599
Endosimbiosis y el genoma de las algas , 605; ¿Origen simbiótico de Cnidaria?, 607;
Holobiontes y hologenomas, 608; Quimerismo, 610; Singamia, fusión genómica y el
origen de la diversidad biótica, 614
Gaia: la metáfora del Planeta Viviente, 620
El mundo de las margaritas, 624; y consideraciones epistemológicas, 624
La revolución bacteriana y la visión de Carl Woese, 628
Biología para un nuevo siglo, 628; ¿Dos imperios o tres dominios?, 632; El árbol de la
vida y el ancestro universal, 635; Teoría de la célula, 636
Ciencia y humanismo: la visión de Erwin Schrödinger, 639
Ciencia y humanismo, 642
La visión organísmica de Ludwig von Bertalanffy, 645
Hacia una física de los sistemas biológicos, 647
El concepto de naturaleza, 651; Naturaleza y ética, 653; Coda, 655
Apéndices, 659
Glosario, 661; Literatura citada, 674; Índice alfabético, 720
