Evolución: El Curso de la Vida

Prólogo......Page 13
Prefacio a la Segunda Edición......Page 19
Introducción......Page 23
Primera parte: El Curso de la Vida......Page 35
Capítulo 1 Origen y Crecimiento del Pensamiento Evolutivo......Page 37
Georges-Louis Leclerc, Comte de Buffon......Page 40
Jean-Baptiste Lamarck......Page 41
Patrick Matthew......Page 43
Ernst Haeckel......Page 44
Sir Richard Owen......Page 45
Los viajes de Wallace y su trabajo......Page 46
Wallace y la selección natural......Page 50
La controversia sobre la correspondencia entre Wallace y Darwin......Page 53
La carrera posterior de Wallace......Page 56
Las ideas de Charles Darwin (1809-1882)......Page 58
Argumentos que apoyan la evolución......Page 63
Externalismo versus internalismo......Page 68
Capítulo 2 Historia Planetaria y Vida Primigenia......Page 71
Fósiles y la explosión del Cámbrico......Page 74
Burgess Shale......Page 78
Colonización del ambiente terrestre......Page 86
El contexto histórico de la evolución de los cordados......Page 87
Extinciones masivas......Page 93
Extinción del Ordovícico (hace 440 Ma)......Page 94
Extinción del Cretácico (hace 65 Ma)......Page 95
Extinciones del Pleistoceno (100.000 años atrás)......Page 96
Capítulo 3 Sistemas Complejos y Orígenes del Orden......Page 97
El modelo de la complejidad......Page 100
El pensamiento complejo......Page 101
Teoría general de sistemas......Page 102
Estructuras disipativas......Page 103
Origen del orden y autoorganización de la materia......Page 105
Teoría del Caos......Page 107
Geometría fractal de la naturaleza......Page 108
Gaia: el Planeta Viviente......Page 109
El modelo de las margaritas......Page 110
Capítulo 4 Síntesis Moderna o Neodarwinismo......Page 113
Adaptacionismo......Page 118
El gradualismo filético......Page 120
Equilibrios intermitentes......Page 121
Selección de especies......Page 123
La darwinización de Mendel......Page 126
La neodarwinización de la ecología......Page 128
Capítulo 5 Equilibrio Poblacional......Page 131
La visión poblacional de la evolución......Page 135
El axioma de Hardy-Weinberg como principio antievolutivo......Page 138
Mutación......Page 140
Mutaciones adaptativas......Page 141
Cálculo de la adecuación biológica (w) y del coeficiente de selección (s)......Page 143
Selección total contra un alelo dominante......Page 145
Selección natural, modelos genético-cuantitativos y la evolución de la plasticidad fenotípica......Page 146
Selección estabilizante o normalizante......Page 147
Selección diversificante o disruptiva y mantención de los polimorfismos balanceados......Page 148
Carga genética y costo de la selección......Page 150
Endogamia......Page 151
Coeficiente de endogamia (F)......Page 152
Cambios aleatorios en las frecuencias alélicas: deriva génica (σ)......Page 154
Cuellos de botella demográficos y genéticos producidos por erupción volcánica......Page 156
Poblaciones y biología de la conservación......Page 157
Tamaño poblacional efectivo (Ne)......Page 158
Influencia de las fluctuaciones poblacionales sobre el Ne......Page 159
Efecto fundador......Page 161
Controversias poblacionales......Page 162
Estructura poblacional y la contienda entre la hipótesis clásica versus la del balance......Page 163
Origen de la variación......Page 164
Genética cuantitativa......Page 168
Selección natural y genética cuantitativa......Page 170
El origen de la endotermia......Page 171
Loci de rasgos cuantitativos (QTL)......Page 173
Capítulo 6 Especies y Especiación: Realidad, Proceso y Resultado......Page 175
Las especies......Page 177
El concepto biológico de especie......Page 181
Concepto fenético de especie......Page 183
Las especies bacterianas......Page 184
Especiación......Page 186
Especiación mediante hibridización......Page 187
Especiación mediante duplicación genómica total: alopoliploidía......Page 190
El modelo alopátrico convencional......Page 191
Modelo de especiación cuántico o peripátrico......Page 192
Especiación por efecto fundador......Page 193
Especiación simpátrica......Page 194
Especies en anillo......Page 196
Experimentos de laboratorio en especiación......Page 197
Especies y radiación adaptativa......Page 198
Realidad de las especies......Page 199
Genómica y especiación......Page 201
Cómo procede el origen de las especies......Page 202
Consideraciones epistemológicas sobre la especiación......Page 203
Capítulo 7 Sistemática e Inducción Filogenética......Page 205
Transformación de los caracteres......Page 209
Cladogramas y árboles......Page 211
Árboles enraizados y no enraizados......Page 213
Filogenia, sistemática y homología......Page 215
Escuelas de clasificación......Page 216
Observaciones, rasgos y evidencias en el pensamiento filogenético......Page 218
Inferencia filogenética......Page 219
Método de distancia Jukes Cantor......Page 220
Ejemplo de un análisis de distancia......Page 221
Máxima parsimonia......Page 222
Duplicación génica y homología molecular......Page 223
Pasos hacia una nueva concepción filogenética......Page 224
Reticulación......Page 228
Análisis de la diversidad genética mediante redes......Page 230
Capítulo 8 Descendencia con Modificación y el Árbol de la Vida......Page 233
Plantae......Page 240
Panorama actual de la clasificación animal......Page 245
El árbol de la vida......Page 248
Capítulo 9 Biogeografía, Deriva Continental y Migraciones......Page 253
Carolus Linnaeus (Linneo)......Page 256
Alexander von Humboldt......Page 257
Origen de los continentes......Page 258
Deriva continental......Page 261
Tectónica de placas......Page 263
Disgregación del supercontinente Pangea......Page 264
Escuela dispersionista......Page 267
Vicarianza......Page 268
Cladogramas de área......Page 269
Regiones o reinos biogeográficos......Page 272
Filogeografía y teoría de coalescencia......Page 274
Teoría de coalescencia......Page 275
Biogeografía de islas......Page 279
El Gran Intercambio Biótico Americano (GIBA)......Page 280
Eventos tectónicos, climáticos y bióticos asociados al Gran Intercambio Biótico Latinoamericano......Page 284
Orogénesis de los Andes y GIBA......Page 285
Indicadores biogeográficos: Nothofagus......Page 287
La Amazonía través del tiempo......Page 288
Mares interiores, Pebas y la biota sudamericana......Page 289
Origen de las gallinas en Sudamérica......Page 290
Origen y evolución de los marsupiales......Page 291
Patagonia, glaciaciones cíclicas y desplazamientos bióticos......Page 292
Alteraciones climáticas y bióticas en el extremo austral del Cono Sur......Page 294
Poblamiento humano de América......Page 296
Huellas genéticas humanas......Page 297
La ruta de migración costera......Page 298
El origen híbrido de Homo sapiens......Page 302
Contrastación de hipótesis en biogeografía......Page 305
Capítulo 10 Cromosomas y Herencia Vertical......Page 309
Centrómeros......Page 315
Traslocaciones robertsonianas......Page 318
Diferencias cromosómicas y especies crípticas en jerbos del género Taterillus......Page 319
El modelo de especiación cromosómica......Page 320
Ingeniería evolutiva y especiación cromosómica......Page 323
Especiación por poliploidía......Page 324
Transformación de los sistemas de determinación del sexo......Page 328
Determinación del sexo sin Sry y sin cromosoma Y......Page 330
Compensación de dosis e inactivación del cromosoma X en mamíferos euterios......Page 331
Estimación del número cromosómico ancestral de los vertebrados......Page 334
Capítulo 11 Transformaciones Moleculares y Genómicas......Page 339
Teoría neutral de evolución molecular......Page 342
El Reloj Molecular......Page 345
Los genes de eucariontes......Page 348
Tasas de sustitución nucleotídica......Page 350
Elementos no codificantes y cambios genéticos rápidos y neutros......Page 354
Duplicación génica y adaptación......Page 356
Evolución concertada......Page 359
Un delirio reduccionista: el gen como unidad evolutiva......Page 360
Secuencias repetidas, LINES y la evolución del genoma......Page 362
Evolución genómica y la paradoja del Valor C......Page 363
Diatomeas......Page 371
Plantas......Page 372
Paramecium tetraurelia......Page 373
Ctenóforos......Page 375
Cefalópodos......Page 376
Tunicados......Page 377
El genoma de amphioxus (Branchiostoma floridae)......Page 378
Genomas de peces......Page 379
El genoma de la gallina......Page 380
El genoma del ornitorrinco (Ornithorhynchus anatinus)......Page 381
El genoma marsupial......Page 382
El genoma de los euterios: la rata (Rattus rattus)......Page 384
El genoma humano (Homo sapiens) y del chimpancé (Pan troglodytes)......Page 385
El genoma antes y después de la secuenciación......Page 389
Silenciamiento génico......Page 391
Segunda parte: Otro Curso de la Vida......Page 395
Capítulo 12 Macroevolución......Page 397
Introducción......Page 399
Transferencia lateral de genes: flujo génico a través de la biosfera......Page 404
Transferencia de genes, cromosomas y genomas completos......Page 408
Origen asexual de especies poliploides por TGL......Page 409
Transferencia lateral de genes a través del Árbol de la Vida......Page 410
Adquisición de adaptaciones complejas por transferencia génica lateral......Page 412
Alopoliploidía: hibridización de linajes y duplicación genómica total......Page 415
Hipótesis 2R, 3R y 5R......Page 416
Poliploidía en bacterias......Page 419
El caso del roedor imposible......Page 420
Hipótesis 2R de poliploidización en los vertebrados......Page 423
Hipotesis 5R en vegetales......Page 427
El paradójico origen de los Phyla......Page 429
Cirripedia......Page 434
Rhyzocephala......Page 436
A la caza de la realidad: el controvertido origen de las larvas......Page 438
Incongruencias larvarias......Page 440
Phyla animales con larva trocófora: poliquetos, equiuroideos, sipunculoideos y moluscos......Page 442
Origen del lofóforo y de las quimeras......Page 445
Experimentos de hibridización entre ascidias y erizos de mar......Page 447
Radiación macroevolutiva de los mamíferos euterios......Page 450
Capítulo 13 Novedades Evolutivas......Page 455
Introducción......Page 457
El Dominio Archaea......Page 461
El pangenoma bacteriano......Page 462
El sistema CRISPR-Cas y la inmunidad lamarckiana......Page 464
Percepción mayoritaria (quorum sensing)......Page 467
El origen de la multicelularidad......Page 469
Multicelularidad naciente: las esponjas......Page 471
Origen de los sistemas neurales: los ctenóforos......Page 473
Origen de los cnidocitos de Cnidaria......Page 474
Origen de los Eucariontes......Page 475
Origen del núcleo......Page 479
Acerca del origen de las plantas......Page 480
Novedades del desarrollo y las raíces de Evo-Devo......Page 484
Novedades ontogenéticas......Page 485
Biología molecular del desarrollo......Page 489
La epigénesis......Page 492
Mecanismos epigenéticos......Page 493
Regulación génica en cis......Page 494
La orquestación del desarrollo en Drosophila melanogaster......Page 497
Los genes Hox en Drosophila melanogaster......Page 501
Los genes Hox en mamíferos......Page 503
Origen de la cabeza y del cerebro de los vertebrados......Page 504
Regulación génica y relojes circadianos......Page 505
Reclutamiento génico (coopción)......Page 506
La ontogenia vegetal......Page 507
Homologías profundas......Page 508
Modularidad......Page 509
Inferencia ontogenética: el ancestro Urbilaterio......Page 511
Reorganización genómica, metamorfosis y macroevolución en insectos holometábolos......Page 512
El paradigma evolutivo Evo-Devo......Page 513
Aproximación macroevolutiva a la descendencia con modificación......Page 514
Éxtasis y agonía de los genes Hox......Page 518
Evolución de los rasgos complejos......Page 522
Emergencia, sistemas complejos y origen de la vida......Page 527
Vida primigenia......Page 530
El origen de la vida......Page 534
El monstruo de Spiegelman......Page 538
Algunas definiciones de vida......Page 539
Capítulo 14 Epistemología, Contexto Histórico y Teoría Evolutiva Actual......Page 543
Adam Smith, el libre mercado y la economía de la naturaleza......Page 545
Herbert Spencer (1820-1903) y la sobrevivencia del más apto......Page 548
La doctrina del shock, Malthus y la eugenesia......Page 550
Darwin al desnudo......Page 554
Darwinismo social. Un ejemplo......Page 556
La estructura de la síntesis evolutiva y sus limitaciones......Page 559
Desdén por la macroevolución......Page 562
La vida como un campo de batalla......Page 563
El sojuzgamiento de la naturaleza......Page 564
Quimerismo y argumentación post hoc......Page 565
Explicación ambiental en referencia a los Rhizocephala (Crustacea, Cirripedia)......Page 566
Domesticación de Evo-Devo......Page 567
Hipótesis ecológicas sobre la explosión del Cámbrico......Page 568
Interpretaciones filogenéticas......Page 569
La visión de recepción de la teoría evolutiva......Page 570
Thomas H. Huxley......Page 571
St. George Mivart......Page 572
La teoría sintética de la evolución como sistema axiomático......Page 574
Principios axiomáticos......Page 575
Axiomas darwinianos y neodarwinianos......Page 576
La vision semántica de la teoría evolutiva......Page 582
Modelos biológicos......Page 588
El método hipotético-deductivo......Page 589
Creacionismo y evolución......Page 592
Diseño Inteligente: el nuevo atuendo del creacionismo......Page 594
Sociobiología o la biologización de las ciencias sociales......Page 595
Capítulo 15 Naturaleza y Ética......Page 597
Simbiosis, holobiontes y singamia......Page 599
Endosimbiosis y el genoma de las algas......Page 605
¿Origen simbiótico de Cnidaria?......Page 607
Holobiontes y hologenomas......Page 608
Caracterización de los holobiontes y sus hologenomas......Page 609
Quimerismo......Page 610
Singamia, fusión genómica y el origen de la diversidad biótica......Page 614
Gaia: la metáfora del Planeta Viviente......Page 620
El mundo de las margaritas y consideraciones epistemológicas......Page 623
Biología para un nuevo siglo......Page 627
¿Dos imperios o tres dominios?......Page 631
El árbol de la vida y el ancestro universal......Page 634
Teoría de la célula......Page 635
Ciencia y humanismo: la visión de Erwin Schrödinger......Page 638
Ciencia y humanismo......Page 641
La visión organísmica de Ludwig von Bertalanffy......Page 644
Hacia una física de los sistemas biológicos......Page 646
El concepto de naturaleza......Page 650
Naturaleza y ética......Page 652
Coda......Page 654
Apéndices......Page 657
Glosario......Page 659
Literatura citada......Page 672
Índice alfabético......Page 718